U.C. 0096 สามปีหลังจากการกบฏของชาร์ บานาเกอร์ ลิงค์ส เด็กชายที่อาศัยอยู่ในนิคมอุตสาหกรรมการผลิต อินดัสเทรียล 7 ได้พบกับหญิงสาวลึกลับที่เรียกตัวเองว่าออเดรย์ เบิร์น ออเดรย์อ้างว่าเธอพยายามหยุดยั้งมูลนิธิวิสต์ไม่ให้ส่งมอบกล่องของลาปลาซให้กับเศษซากของนีโอซีออนที่รู้จักกันในชื่อสลีฟส์ การกระทำดังกล่าวอาจจุดชนวนให้เกิดสงครามอีกครั้ง และบานาเกอร์จึงตัดสินใจช่วยเธอ แต่ที่นิคมแห่งนี้กลับกลายเป็นสนามรบเมื่อการต่อสู้ปะทุขึ้นระหว่างสลีฟส์และกองกำลังสหพันธ์โลก ซึ่งมาเพื่อหยุดยั้งการส่งมอบเช่นกัน...
