เมิร์ค สตอเรีย เกิดขึ้นในโลกซึ่งมนุษย์และมอนสเตอร์อาศัยอยู่ร่วมกัน ตัวละครหลัก "ยู" เป็นฮีลเลอร์ฝึกหัด และมีความสามารถในการฝึกมอนสเตอร์ให้เชื่องได้ ในภารกิจเพื่อรื้อฟื้นความทรงจำของเมิร์ค หญิงสาวผู้ถูกขังไว้ในขวดแก้ว ทั้งสองต้องร่วมมือกันโดยตลอดทั้งเรื่อง
