Con Freeman sotto processo, l’equipaggio cerca di dimostrare la sua innocenza. Nel corso della stagione, i protagonisti affrontano prove personali: Boimler tenta di essere più audace, Mariner riflette sul suo futuro nella Flotta, e Tendi intraprende un nuovo percorso come ufficiale scientifico. La stagione culmina con la distruzione della USS Aledo, una nave dotata di intelligenza artificiale, e la rivelazione che Freeman è stata incastrata. Nel finale, la Cerritos si unisce ad altre navi di Classe California per sventare una minaccia, dimostrando il proprio valore.
